Mirá, en cuánto a los sidestories y el resto de los mangas que están publicándose ahora, te recomiendo que tomes los que más te gustaron y los utilices cómo base. En cuánto a la historia, estaría bueno que no caigas en lugares comunes, cómo revivir a los Santos de Oro o volver a dejar ciego a Shiryu. Creá un nuevo ejército, utilizá historias y cosas de la mitología y adaptalas a tu idea.
Por ejemplo, para mi Fic (La Guerra Definitiva) me basé en la Serie original, Episodio G, Gigantomachia y la supuesta Saga del Cielo y ambienté mi Fic en el futuro, con un nuevo ejército y nuevos personajes. Utilicé también mucho la Mitología, pieza fundamental para mi Fanfic. Por supuesto que inventé muchos de los hechos a los que hago referencia en el Fic sobre Ep G y la Saga del Cielo, pues cómo no terminaron no sé que va a pasar. Pero ta, esas son mis recomendaciones. Tomá en cuenta, sobretodo, la de no caer en un lugar común. Lo de revivir a los Santos de Oro es algo que se repite Fic a Fic, y nunca se explica ni cómo, ni porqué y ni para qué revivieron. SI los vas a revivir, por lo menos dale un sentido.
Espero te ayude
Salu2