No muestra nada específico Kurumada en su comic de como se determina, pero si deja algunos indicios.
Uno, y lógicamente, siempre es un Santo de rango superior el que entrena al aprendiz. Es decir, los Silver Saints, siempre entrenan a los Bronze, y los Santos de Oro a los Bronze y Silver y nunca al revés.
Dos, los Santos de Oro entrenan a otros Santos de Oro. Es claro en el caso de Aries Sion, y en Zero Kurumada deja aun mas claro que incluso los demás Gold tenían maestros, aunque no especifica su rango; pero es claro que seguramente era de la misma categoría para poder enseñarles los misterios del Cosmo al nivel que ellos lo necesitaban.
Tres, Virgo Shaka no entrenó solo. Hay dos instancias en el comic que lo prueban. Uno, conversa con el Iluminado, que no es su maestro como Santo pero si recibió instrucción de él y otros dioses con quienes conversaba, el mismo lo dice. Y en Zero, Kuru deja claro que tuvo maestro porque volvió a él.
Cuatro, aunque usualmente es el rango superior el que entrena al inferior, hay un caso al menos en que fue al revés, y fue en el caso de los Santos de Oro del siglo XVIII. Ellos recibieron mucha instrucción de Ophiuchus Odysseus, que era un Silver Saint, debido a su poder extremo y dominio magistral del Cosmo. Nunca revela Kuru si él fue el único maestro que tuvieron, pero de que tuvo mucha influencia en su formación como Santos, eso no queda en duda para nada.
Cinco, al parecer los discípulos se escojen tomando en cuenta algunos criterios de compatibilidad entre alumno y discípulo, al menos en el caso de los Bronze. Sus lugares de entrenamiento les fueron asignados al azar, (aunque en realidad fué el destino el que determinó esto y no el azar), pero, ya estando ahí, se buscó a alguien que estuviera en condiciones de tener una mejor relación con el alumno; por ejemplo, como muestra Kuru en el vol. 1, a Eagle Marin se le asignó a Seiya porque uno, ella era ya una Silver, y dos, porque ella tambien era japonesa, asi mismo lo dice el sujeto raro ese que se lo entrega a ella. Ya que los dos eran japoneses, no iba a haber problemas de comunicación, considerando que el era sólo un niñito y además estaba en Grecia, no iba a entender ni papa de lo que le decían hasta que aprendiera xD. Otro ejemplo serían Kraken Isaak y Cygnus "Ioga" xD, le fueron asignados ambos a Aquarius Camus con seguridad por ser los tres europeos, asi que aunque sea en inglés iban a poder hablar. Es claro que hay algo de azar tambien en quien queda con quien, pero tambien es claro que se decide quien entrena a los aprendices en base a su dominio del Cosmo. Nadie iba a ponerle un discípulo a Musca Dio, por asi decirlo.
Seis, algunas parejas de maestro-alumno fueron creadas por Kuru en atención al trasfondo de los personajes y sus constelaciones, para enfatizar el motivo de la relación maestro y discípulo. Es decir, aqui es fácil notar que es por puro aspecto creativo del Kuru, como en el caso de Dragon Shiryū y Libra Dōko, por la clásica dualidad tigre-dragón del folklore asiático, Cepheus Daidalos y Andromeda Shun, por ser Cepheus el papá de Andromeda en la mitología griega, Guilty y Phoenix Ikki, por representar el primero un Rangda y el segundo al fénix, seres muy poderosos de fuego, otro caso es el de Cygnus Hyōga y Aquarius Camus, al principio Kuru había hecho que el maestro era Scorpio Milo (e incluso dibujó algunas páginas con él en ese papel) pero luego cambió de idea cuando notó que entre las constelaciones y su estilo de manejo del Cosmo había una relación. En algunos casos Kuru hizo la relación de una manera más sutil, como en los personajes que comparten técnicas, como Marin y Seiya.
Siete, nada en el canon dice que los Santos de Aries escojen a Santos sólo de su constelación. En el caso de Sion y Mū, pues puede ser simple coincidencia aunque podría ser que los Santos de Oro escojan a alguien que llevará su misma constelación, pero eso implica que no es algo exclusivo de los Aries, y además, las artes de restauración de Cloths no son algo que se pase solo a alguien de la misma constelación. Kiki es Aries, si, pero no es aprendiz de Santo, el mismo lo dice en el arc de Poseidon.
Ocho, no es algo que sea un deber para los Santos. Nada en el canon confirma eso. Al parecer es simplemente una responsabilidad que se les asigna cuando ya es momento de formar el ejercito de Athena cuando ella esta por volver o cuando ya lo hizo, como se muestra en el vol. 13 del comic de Kuru cuando Aries Sion ha empezado a formar el ejército de Athena ya en 1976 cuando ella acababa de volver a la tierra; el ya tenía varios años haciendo esto porque como el mismo lo menciona, ya estaban todos los Santos de Oro para ese momento y tambien ya habían Bronze y Silver, pero la mayoría eran muy jóvenes. Asi que, es claro que es una responsabilidad del Pontífice iniciar ese proceso, y seguramente él determina quienes están mejor calificados para entrenar discípulos. A algunos les corresponderá, a otros no, todo debe tener relación con su dominio del Cosmo, cualidades personales y como Santo de Athena, disponibilidad, etc.
Asi que eso mas o menos si no se me olvida nada es lo que muestra Kuru en su comic. No parece ser que sea un deber de los Santos de Athena tener discípulo, sino que es algo que se da en ocasiones debido a ciertas circunstancias. Si nunca tienen un alumno, pues, no pasa nada xD